สำนักงานเกษตรจังหวัดอุทัยธานี ตั้งขึ้นตามพระราชกฤษฎีกาแบ่งส่วนราชการของกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ พ.ศ.2511 โดยได้รวมกรมกสิกรรมกับกรมการข้าว จัดตั้งเป็นกรมส่งเสริมการเกษตร เมื่อวันที่ 21 ตุลาคม 2511 โดยมี ศาสตราจารย์พิเศษ ทำนอง สิงคาลวณิช เป็นอธิบดีคนแรก
ปัจจุบันสำนักงานเกษตรจังหวัดอุทัยธานี ตั้งอยู่ที่ 32 หมู่ 2 ตำบลน้ำซึม อำเภอเมืองอุทัยธานี จังหวัดอุทัยธานี โดยมีนางสมพิศ ขวัญสูงเนิน ดำรงตำแหน่งเกษตรจังหวัดอุทัยธานี (ปี พ.ศ. 2567)
